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熒光定量Q-PCR檢測(cè)知識(shí)“大攻略”!
更新時(shí)間:2019-03-18   點(diǎn)擊次數(shù):1251次
   熒光定量Q-PCR檢測(cè)知識(shí)“大攻略”!
  熒光定量Q-PCR檢測(cè)的理論依據(jù)是什通過(guò)特定的待擴(kuò)增基因片段起始含量越大,則指數(shù)擴(kuò)增過(guò)程越短,當(dāng)擴(kuò)增速率趨于穩(wěn)定后,則無(wú)論原來(lái)樣品中起始模板含量多少,終擴(kuò)增片段的含量通常是一樣的。
  理想的擴(kuò)增結(jié)果:Y=X×2n;
  其中Y代表擴(kuò)增產(chǎn)物量,X代表PCR反應(yīng)體中的原始模板數(shù)n為擴(kuò)增次數(shù);理論上PCR擴(kuò)增效率為100%,PCR產(chǎn)物隨著循環(huán)的進(jìn)行成指數(shù)增長(zhǎng),但實(shí)際上:DNA的每一次復(fù)制都不*,即每一次擴(kuò)增中,模板不是呈2的倍增長(zhǎng);實(shí)際應(yīng)為:Y=X(1+E)n,其中E代表擴(kuò)增效率:E=參與復(fù)制的模板/總模板,通常E≤1,E在整個(gè)PCR擴(kuò)增過(guò)程中不是固定不變的。通常X在1-105拷貝、循環(huán)次數(shù)n≤30時(shí),E相對(duì)穩(wěn)定,原始模板以相對(duì)固定的指數(shù)形式增加,適合定量分析,這也就是所謂的指數(shù)期;隨著循環(huán)次數(shù)n的增加(>30次),E值逐漸減少,Y呈非固定的指數(shù)形式增加,后進(jìn)入平臺(tái)期。
  熒光定量Q-PCR檢測(cè)的理論模式:
  PCR是對(duì)原始待測(cè)模板核酸的一個(gè)擴(kuò)增過(guò)程,任何干擾PCR指數(shù)擴(kuò)增的因素都會(huì)影響擴(kuò)增產(chǎn)物的量,使得PCR擴(kuò)增終產(chǎn)物的數(shù)量與原始模板數(shù)量之間沒(méi)有一個(gè)固定的比例關(guān)系,通過(guò)檢測(cè)擴(kuò)增終產(chǎn)物很難對(duì)原始模板進(jìn)行準(zhǔn)確定量。
  PCR擴(kuò)增通式:
  1.Tn=T0(1+E)n;
     2.Tn=Tn-1(1+E)n。
  注:[0其中E表示擴(kuò)增效率,n為循環(huán)數(shù),Tn表示在n個(gè)周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,Tn-1表示在n-1個(gè)周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,T0為原始模板數(shù)量。設(shè)定PCR到達(dá)指數(shù)擴(kuò)增期時(shí),產(chǎn)生一定的熒光(熒光依賴(lài)于某一循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物的總量,即特定的拷貝數(shù)K,為常數(shù),大約在1010左右)高于背景為儀器所識(shí)別,此時(shí)的循環(huán)數(shù)為CP,也就是K=T0(1+E)CP,取對(duì)數(shù)即:
  lg K=lg T0+CP*lg(1+E);
  CP=-1/lg(1+E)*lg T0+lgk/lg(1+E)。
  由于對(duì)一特定的PCR而言,E與K均為常數(shù),故上式為循環(huán)數(shù)(CP)對(duì)原始模板拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)(lg T0)一次方程,其標(biāo)準(zhǔn)形式y(tǒng)=kx+b,該直線(xiàn)的斜率為-1/lg(1+E),在橫坐標(biāo)上的截距為lgk/lg(1+E),也是熒光定量PCR所謂的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。
  根據(jù)PCR擴(kuò)增過(guò)程中是否加入某種標(biāo)記物、標(biāo)記物的種類(lèi)以及后檢測(cè)的信號(hào)的不同可分為四種類(lèi)型:
  直接定量檢測(cè)法;同位素標(biāo)記定量;酶標(biāo)記定量檢測(cè)法;熒光定量Q-PCR技術(shù)。
  熒光定量PCR主要原理發(fā)射波長(zhǎng)與受體熒光染料光染料吸收供體熒光傳遞的能量而激發(fā)出另一波長(zhǎng)的熒光,同時(shí)將供體熒光淬滅。
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